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include/igl/copyleft/tetgen/cdt.cpp

@@ -26,16 +26,14 @@ IGL_INLINE bool igl::copyleft::tetgen::cdt(
 {
   using namespace Eigen;
   using namespace std;
-  typedef Eigen::PlainObjectBase<DerivedV> MatrixXS;
-  typedef Eigen::PlainObjectBase<DerivedF> MatrixXI;
   // Effective input mesh
-  MatrixXS U;
-  MatrixXI G;
+  DerivedV U;
+  DerivedF G;
   if(param.use_bounding_box)
   {
     // Construct bounding box mesh
-    MatrixXS BV;
-    MatrixXI BF;
+    DerivedV BV;
+    DerivedF BF;
     bounding_box(V,BV,BF);
     // scale bounding box
     const RowVector3d mid = 

include/igl/point_simplex_squared_distance.cpp

@@ -28,8 +28,8 @@ IGL_INLINE void igl::point_simplex_squared_distance(
   const Eigen::MatrixBase<DerivedEle> & Ele,
   const typename DerivedEle::Index primitive,
   Derivedsqr_d & sqr_d,
-  Eigen::PlainObjectBase<Derivedc> & c,
-  Eigen::PlainObjectBase<Derivedb> & bary)
+  Eigen::MatrixBase<Derivedc> & c,
+  Eigen::MatrixBase<Derivedb> & bary)
 {
   typedef typename Derivedp::Scalar Scalar;
   typedef typename Eigen::Matrix<Scalar,1,DIM> Vector;
@@ -147,7 +147,7 @@ IGL_INLINE void igl::point_simplex_squared_distance(
   const Eigen::MatrixBase<DerivedEle> & Ele,
   const typename DerivedEle::Index primitive,
   Derivedsqr_d & sqr_d,
-  Eigen::PlainObjectBase<Derivedc> & c)
+  Eigen::MatrixBase<Derivedc> & c)
 {
   // Use Dynamic because we don't know Ele.cols() at compile time.
   Eigen::Matrix<typename Derivedc::Scalar,1,Eigen::Dynamic> b;
@@ -156,10 +156,10 @@ IGL_INLINE void igl::point_simplex_squared_distance(
 
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instanciation
-template void igl::point_simplex_squared_distance<3, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&);
-template void igl::point_simplex_squared_distance<2, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&);
-template void igl::point_simplex_squared_distance<3, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&);
-template void igl::point_simplex_squared_distance<3, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 3, 1, 1, 1, 3> >&);
-template void igl::point_simplex_squared_distance<2, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&);
-template void igl::point_simplex_squared_distance<2, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 2, 1, 1, 1, 2> >&);
+template void igl::point_simplex_squared_distance<3, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&);
+template void igl::point_simplex_squared_distance<2, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&);
+template void igl::point_simplex_squared_distance<3, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&);
+template void igl::point_simplex_squared_distance<3, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 3, 1, 1, 1, 3> >&);
+template void igl::point_simplex_squared_distance<2, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&);
+template void igl::point_simplex_squared_distance<2, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, double, Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Index, double&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 1, 2, 1, 1, 2> >&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, 2, 1, 1, 1, 2> >&);
 #endif

include/igl/point_simplex_squared_distance.h

@@ -35,7 +35,7 @@ namespace igl
     const Eigen::MatrixBase<DerivedEle> & Ele,
     const typename DerivedEle::Index i,
     Derivedsqr_d & sqr_d,
-    Eigen::PlainObjectBase<Derivedc> & c);
+    Eigen::MatrixBase<Derivedc> & c);
   // Determine squared distance from a point to linear simplex.
   // Also return barycentric coordinate of closest point. 
   //
@@ -63,8 +63,8 @@ namespace igl
     const Eigen::MatrixBase<DerivedEle> & Ele,
     const typename DerivedEle::Index i,
     Derivedsqr_d & sqr_d,
-    Eigen::PlainObjectBase<Derivedc> & c,
-    Eigen::PlainObjectBase<Derivedb> & b);
+    Eigen::MatrixBase<Derivedc> & c,
+    Eigen::MatrixBase<Derivedb> & b);
 }
 #ifndef IGL_STATIC_LIBRARY
 #  include "point_simplex_squared_distance.cpp"