setxor, correct indices assuming colmajor

Former-commit-id: 1585697bd8e84a35301f9e39d43c37f0fb33b592

include/igl/matrix_to_list.cpp

@@ -11,7 +11,7 @@
 
 template <typename DerivedM>
 IGL_INLINE void igl::matrix_to_list(
-  const Eigen::MatrixBase<DerivedM> & M,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedM> & M,
   std::vector<std::vector<typename DerivedM::Scalar > > & V)
 {
   using namespace std;
@@ -29,7 +29,7 @@ IGL_INLINE void igl::matrix_to_list(
 
 template <typename DerivedM>
 IGL_INLINE void igl::matrix_to_list(
-  const Eigen::MatrixBase<DerivedM> & M,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedM> & M,
   std::vector<typename DerivedM::Scalar > & V)
 {
   using namespace std;
@@ -46,7 +46,7 @@ IGL_INLINE void igl::matrix_to_list(
 
 template <typename DerivedM>
 IGL_INLINE std::vector<typename DerivedM::Scalar > igl::matrix_to_list(
-    const Eigen::MatrixBase<DerivedM> & M)
+    const Eigen::DenseBase<DerivedM> & M)
 {
   std::vector<typename DerivedM::Scalar> V;
   matrix_to_list(M,V);
@@ -56,17 +56,17 @@ IGL_INLINE std::vector<typename DerivedM::Scalar > igl::matrix_to_list(
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template specialization
 // generated by autoexplicit.sh
-template std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> > igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&);
+template std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> > igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&);
 // generated by autoexplicit.sh
-template std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> > igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&);
+template std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> > igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&);
 //template void igl::matrix_to_list<Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >, double>(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<std::vector<double, std::allocator<double> >, std::allocator<std::vector<double, std::allocator<double> > > >&);
 //template void igl::matrix_to_list<Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >, int>(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > >&);
-template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> >, std::allocator<std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> > > >&);
-template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> >, std::allocator<std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> > > >&);
-template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> >&);
-template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> >&);
-template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> >&);
-template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, std::vector<std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> >, std::allocator<std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> > > >&);
-template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> >&);
-template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1>::Scalar> >&);
+template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> >, std::allocator<std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> > > >&);
+template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> >, std::allocator<std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> > > >&);
+template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> >&);
+template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> >&);
+template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> >&);
+template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, std::vector<std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> >, std::allocator<std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> > > >&);
+template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> >&);
+template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1>::Scalar> >&);
 #endif

include/igl/matrix_to_list.h

@@ -28,7 +28,7 @@ namespace igl
   // See also: list_to_matrix
   template <typename DerivedM>
   IGL_INLINE void matrix_to_list(
-    const Eigen::MatrixBase<DerivedM> & M, 
+    const Eigen::DenseBase<DerivedM> & M, 
     std::vector<std::vector<typename DerivedM::Scalar > > & V);
   // Convert a matrix to a list (std::vector) of elements in column-major
   // ordering.
@@ -39,12 +39,12 @@ namespace igl
   //    V  an m*n list of elements
   template <typename DerivedM>
   IGL_INLINE void matrix_to_list(
-    const Eigen::MatrixBase<DerivedM> & M, 
+    const Eigen::DenseBase<DerivedM> & M, 
     std::vector<typename DerivedM::Scalar > & V);
   // Return wrapper
   template <typename DerivedM>
   IGL_INLINE std::vector<typename DerivedM::Scalar > matrix_to_list(
-      const Eigen::MatrixBase<DerivedM> & M);
+      const Eigen::DenseBase<DerivedM> & M);
 }
 
 #ifndef IGL_STATIC_LIBRARY

include/igl/setdiff.cpp

@@ -17,8 +17,8 @@ template <
   typename DerivedC,
   typename DerivedIA>
 IGL_INLINE void igl::setdiff(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA> & A,
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedB> & B,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedA> & A,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedB> & B,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedC> & C,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA> & IA)
 {
@@ -33,8 +33,17 @@ IGL_INLINE void igl::setdiff(
   if(B.size() == 0)
   {
     C.resize(A.size(),1);
-    copy(A.data(),A.data()+A.size(),C.data());
-    IA = igl::colon<typename DerivedIA::Scalar>(0,C.size()-1);
+    int k = 0;
+    for(int j = 0;j<A.cols();j++)
+    {
+      for(int i = 0;i<A.rows();i++)
+      {
+        C(k++) = A(i,j);
+      }
+    }
+    assert(k == C.size());
+    IA = Eigen::Matrix<typename DerivedIA::Scalar,Eigen::Dynamic,1>::LinSpaced(
+      C.size(),0,C.size()-1);
   }
 
   // Get rid of any duplicates
@@ -79,7 +88,7 @@ IGL_INLINE void igl::setdiff(
 
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template specialization
-template void igl::setdiff<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::setdiff<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::setdiff<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::setdiff<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::setdiff<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::setdiff<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 #endif

include/igl/setdiff.h

@@ -26,8 +26,8 @@ namespace igl
     typename DerivedC,
     typename DerivedIA>
   IGL_INLINE void setdiff(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA> & A,
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedB> & B,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedA> & A,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedB> & B,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedC> & C,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA> & IA);
 }

include/igl/setunion.cpp

@@ -24,16 +24,16 @@ IGL_INLINE void igl::setunion(
   DerivedC CS(A.size()+B.size(),1);
   {
     int k = 0;
-    for(int i = 0;i<A.rows();i++)
+    for(int j = 0;j<A.cols();j++)
     {
-      for(int j = 0;j<A.cols();j++)
+      for(int i = 0;i<A.rows();i++)
       {
         CS(k++) = A(i,j);
       }
     }
-    for(int i = 0;i<B.rows();i++)
+    for(int j = 0;j<B.cols();j++)
     {
-      for(int j = 0;j<B.cols();j++)
+      for(int i = 0;i<B.rows();i++)
       {
         CS(k++) = B(i,j);
       }

include/igl/setxor.cpp

@@ -0,0 +1,39 @@
+#include "setxor.h"
+#include "setdiff.h"
+#include "setunion.h"
+#include "slice.h"
+#include <iostream>
+#include <igl/matlab_format.h>
+
+template <
+  typename DerivedA,
+  typename DerivedB,
+  typename DerivedC,
+  typename DerivedIA,
+  typename DerivedIB>
+IGL_INLINE void igl::setxor(
+  const Eigen::DenseBase<DerivedA> & A,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedB> & B,
+  Eigen::PlainObjectBase<DerivedC> & C,
+  Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA> & IA,
+  Eigen::PlainObjectBase<DerivedIB> & IB)
+{
+  DerivedC AB,BA;
+  DerivedIA IAB,IBA;
+  setdiff(A,B,AB,IAB);
+  std::cout<<igl::matlab_format(AB.transpose(),"AB")<<std::endl;
+  std::cout<<igl::matlab_format(IAB.transpose().array()+1,"IAB")<<std::endl;
+  setdiff(B,A,BA,IBA);
+  std::cout<<igl::matlab_format(BA.transpose(),"BA")<<std::endl;
+  std::cout<<igl::matlab_format(IBA.transpose().array()+1,"IBA")<<std::endl;
+  setunion(AB,BA,C,IA,IB);
+
+  std::cout<<igl::matlab_format(C.transpose(),"C")<<std::endl;
+  std::cout<<igl::matlab_format(IA.transpose().array()+1,"IA")<<std::endl;
+  std::cout<<igl::matlab_format(IB.transpose().array()+1,"IB")<<std::endl;
+  slice(IAB,DerivedIA(IA),IA);
+  slice(IBA,DerivedIB(IB),IB);
+
+  std::cout<<igl::matlab_format(IA.transpose().array()+1,"IA")<<std::endl;
+  std::cout<<igl::matlab_format(IB.transpose().array()+1,"IB")<<std::endl;
+}

include/igl/setxor.h

@@ -0,0 +1,43 @@
+// This file is part of libigl, a simple c++ geometry processing library.
+// 
+// Copyright (C) 2016 Alec Jacobson <alecjacobson@gmail.com>
+// 
+// This Source Code Form is subject to the terms of the Mozilla Public License 
+// v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can 
+// obtain one at http://mozilla.org/MPL/2.0/.
+#ifndef IGL_SETXOR_H
+#define IGL_SETXOR_H
+#include "igl_inline.h"
+#include <Eigen/Core>
+namespace igl
+{
+  // Set xor of elements of matrices
+  //
+  // Inputs:
+  //   A  m-long vector of indices
+  //   B  n-long vector of indices
+  // Outputs:
+  //   C  (k<=m)-long vector of unique elements appearing in A but not in B or
+  //     B but not in A
+  //   IA  (<k<=m)-long list of indices into A so that C = sort([A(IA);B(IB)])
+  //   IB  (<k<=m)-long list of indices into B so that C = sort([A(IA);B(IB)])
+  //
+  template <
+    typename DerivedA,
+    typename DerivedB,
+    typename DerivedC,
+    typename DerivedIA,
+    typename DerivedIB>
+  IGL_INLINE void setxor(
+    const Eigen::DenseBase<DerivedA> & A,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedB> & B,
+    Eigen::PlainObjectBase<DerivedC> & C,
+    Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA> & IA,
+    Eigen::PlainObjectBase<DerivedIB> & IB);
+}
+
+#ifndef IGL_STATIC_LIBRARY
+#  include "setxor.cpp"
+#endif
+#endif
+

include/igl/sort.cpp

@@ -19,7 +19,7 @@
 
 template <typename DerivedX, typename DerivedY, typename DerivedIX>
 IGL_INLINE void igl::sort(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
   const int dim,
   const bool ascending,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedY>& Y,
@@ -82,7 +82,7 @@ IGL_INLINE void igl::sort(
 
 template <typename DerivedX, typename DerivedY, typename DerivedIX>
 IGL_INLINE void igl::sort_new(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
   const int dim,
   const bool ascending,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedY>& Y,
@@ -150,7 +150,7 @@ IGL_INLINE void igl::sort_new(
 
 template <typename DerivedX, typename DerivedY, typename DerivedIX>
 IGL_INLINE void igl::sort2(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
   const int dim,
   const bool ascending,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedY>& Y,
@@ -159,7 +159,12 @@ IGL_INLINE void igl::sort2(
   using namespace Eigen;
   using namespace std;
   typedef typename DerivedY::Scalar YScalar;
-  Y = X.template cast<YScalar>();
+  // DenseBase doesn't have a .cast function...
+  //Y = X.template cast<YScalar>();
+  Y.resizeLike(X);
+  for(int j=0;j<X.cols();j++)for(int i=0;i<X.rows();i++)Y(i,j)=(YScalar)X(i,j);
+
+
   // get number of columns (or rows)
   int num_outer = (dim == 1 ? X.cols() : X.rows() );
   // get number of rows (or columns)
@@ -193,7 +198,7 @@ IGL_INLINE void igl::sort2(
 
 template <typename DerivedX, typename DerivedY, typename DerivedIX>
 IGL_INLINE void igl::sort3(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
   const int dim,
   const bool ascending,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedY>& Y,
@@ -202,7 +207,11 @@ IGL_INLINE void igl::sort3(
   using namespace Eigen;
   using namespace std;
   typedef typename DerivedY::Scalar YScalar;
-  Y = X.template cast<YScalar>();
+  // DenseBase doesn't have a .cast function...
+  //Y = X.template cast<YScalar>();
+  Y.resizeLike(X);
+  for(int j=0;j<X.cols();j++)for(int i=0;i<X.rows();i++)Y(i,j)=(YScalar)X(i,j);
+
   // get number of columns (or rows)
   int num_outer = (dim == 1 ? X.cols() : X.rows() );
   // get number of rows (or columns)
@@ -311,32 +320,26 @@ if(!ascending)
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template specialization
 // generated by autoexplicit.sh
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-// generated by autoexplicit.sh
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 template void igl::sort<int>(std::vector<int, std::allocator<int> > const&, bool, std::vector<int, std::allocator<int> >&, std::vector<size_t,class std::allocator<size_t> > &);
-
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-// generated by autoexplicit.sh
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::sort_new<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6>, Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6>, Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4>, Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4>, Eigen::Matrix<int, -1, 4, 0, -1, 4> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 4, 0, -1, 4> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::sort_new<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6>, Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6>, Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4>, Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4>, Eigen::Matrix<int, -1, 4, 0, -1, 4> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 4, 0, -1, 4> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 template void igl::sort<long>(std::vector<long, std::allocator<long> > const&, bool, std::vector<long, std::allocator<long> >&, std::vector<unsigned long, std::allocator<unsigned long> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-
-template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 1, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 1, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 #endif

include/igl/sort.h

@@ -32,7 +32,7 @@ namespace igl
   //     for j = 1:n, Y(:,j) = X(I(:,j),j); end
   template <typename DerivedX, typename DerivedY, typename DerivedIX>
   IGL_INLINE void sort(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
     const int dim,
     const bool ascending,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedY>& Y,
@@ -40,7 +40,7 @@ namespace igl
   template <typename DerivedX, typename DerivedY, typename DerivedIX>
   // Only better if size(X,dim) is small
   IGL_INLINE void sort_new(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
     const int dim,
     const bool ascending,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedY>& Y,
@@ -48,7 +48,7 @@ namespace igl
   // Special case if size(X,dim) == 2
   template <typename DerivedX, typename DerivedY, typename DerivedIX>
   IGL_INLINE void sort2(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
     const int dim,
     const bool ascending,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedY>& Y,
@@ -56,7 +56,7 @@ namespace igl
   // Special case if size(X,dim) == 3
   template <typename DerivedX, typename DerivedY, typename DerivedIX>
   IGL_INLINE void sort3(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
     const int dim,
     const bool ascending,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedY>& Y,

include/igl/sortrows.cpp

@@ -18,7 +18,7 @@
 // Obsolete slower version converst to vector
 //template <typename DerivedX, typename DerivedIX>
 //IGL_INLINE void igl::sortrows(
-//  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+//  const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
 //  const bool ascending,
 //  Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& Y,
 //  Eigen::PlainObjectBase<DerivedIX>& IX)
@@ -51,7 +51,7 @@
 
 template <typename DerivedX, typename DerivedIX>
 IGL_INLINE void igl::sortrows(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
   const bool ascending,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& Y,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedIX>& IX)
@@ -106,11 +106,11 @@ IGL_INLINE void igl::sortrows(
 }
 
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
-template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 #endif

include/igl/sortrows.h

@@ -28,7 +28,7 @@ namespace igl
   //     Y = X(I,:);
   template <typename DerivedX, typename DerivedI>
   IGL_INLINE void sortrows(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& X,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedX>& X,
     const bool ascending,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedX>& Y,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedI>& I);

include/igl/unique.cpp

@@ -77,7 +77,7 @@ template <
   typename DerivedIA,
   typename DerivedIC>
 IGL_INLINE void igl::unique(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA> & A,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedA> & A,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedC> & C,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA> & IA,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedIC> & IC)
@@ -99,7 +99,7 @@ template <
   typename DerivedC
   >
 IGL_INLINE void igl::unique(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA> & A,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedA> & A,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedC> & C)
 {
   using namespace std;
@@ -200,7 +200,7 @@ IGL_INLINE void igl::unique(
 
 template <typename DerivedA, typename DerivedIA, typename DerivedIC>
 IGL_INLINE void igl::unique_rows(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA>& A,
+  const Eigen::DenseBase<DerivedA>& A,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedA>& C,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA>& IA,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedIC>& IC)
@@ -260,29 +260,29 @@ IGL_INLINE void igl::unique_rows(
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template specialization
 template void igl::unique<int>(std::vector<int, std::allocator<int> > const&, std::vector<int, std::allocator<int> >&, std::vector<size_t, std::allocator<size_t> >&, std::vector<size_t, std::allocator<size_t> >&);
-template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 template void igl::unique<int>(std::vector<int, std::allocator<int> > const&, std::vector<int, std::allocator<int> >&);
 template void igl::unique<long>(std::vector<long, std::allocator<long> > const&, std::vector<long, std::allocator<long> >&, std::vector<unsigned long, std::allocator<unsigned long> >&, std::vector<unsigned long, std::allocator<unsigned long> >&);
-template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
-template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::unique<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::unique<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::unique<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::unique<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 template void igl::unique<double>(std::vector<double, std::allocator<double> > const&, std::vector<double, std::allocator<double> >&);
-template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::unique<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 
 #ifdef WIN32
-template void __cdecl igl::unique_rows<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, class Eigen::Matrix<__int64, -1, 1, 0, -1, 1>, class Eigen::Matrix<__int64, -1, 1, 0, -1, 1> >(class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const &, class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > &, class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<__int64, -1, 1, 0, -1, 1> > &, class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<__int64, -1, 1, 0, -1, 1> > &);
+template void __cdecl igl::unique_rows<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, class Eigen::Matrix<__int64, -1, 1, 0, -1, 1>, class Eigen::Matrix<__int64, -1, 1, 0, -1, 1> >(class Eigen::DenseBase<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const &, class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > &, class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<__int64, -1, 1, 0, -1, 1> > &, class Eigen::PlainObjectBase<class Eigen::Matrix<__int64, -1, 1, 0, -1, 1> > &);
 #endif
 
 #endif

include/igl/unique.h

@@ -39,7 +39,7 @@ namespace igl
     typename DerivedIA,
     typename DerivedIC>
   IGL_INLINE void unique(
-      const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA> & A,
+      const Eigen::DenseBase<DerivedA> & A,
       Eigen::PlainObjectBase<DerivedC> & C,
       Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA> & IA,
       Eigen::PlainObjectBase<DerivedIC> & IC);
@@ -47,7 +47,7 @@ namespace igl
     typename DerivedA,
     typename DerivedC>
   IGL_INLINE void unique(
-      const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA> & A,
+      const Eigen::DenseBase<DerivedA> & A,
       Eigen::PlainObjectBase<DerivedC> & C);
   // Act like matlab's [C,IA,IC] = unique(X,'rows')
   //
@@ -63,7 +63,7 @@ namespace igl
   //   IC  #A index vector so that A = C(IC,:);
   template <typename DerivedA, typename DerivedIA, typename DerivedIC>
   IGL_INLINE void unique_rows(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA>& A,
+    const Eigen::DenseBase<DerivedA>& A,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedA>& C,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA>& IA,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedIC>& IC);