templates, tutorial missing libs

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include/igl/angles.cpp

@@ -6,6 +6,7 @@
 // v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can
 // obtain one at http://mozilla.org/MPL/2.0/.
 #include "angles.h"
+#include <Eigen/Geometry>
 #include <cassert>
 
 template <
@@ -46,4 +47,5 @@ void igl::angles(
 
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template specialization
+template void igl::angles<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 #endif

include/igl/boundary_loop.cpp

@@ -32,7 +32,7 @@ IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
 
   vector<bool> unvisited = is_border_vertex(Vdummy,F);
   set<int> unseen;
-  for (int i = 0; i < unvisited.size(); ++i)
+  for (size_t i = 0; i < unvisited.size(); ++i)
   {
     if (unvisited[i])
       unseen.insert(unseen.end(),i);
@@ -61,7 +61,7 @@ IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
 
         if (TT.row(fid).minCoeff() < 0.) // Face contains boundary edge
         {
-          int vLoc;
+          int vLoc = -1;
           if (F(fid,0) == v) vLoc = 0;
           if (F(fid,1) == v) vLoc = 1;
           if (F(fid,2) == v) vLoc = 2;
@@ -105,8 +105,8 @@ IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
   boundary_loop(F,Lall);
 
   int idxMax = -1;
-  int maxLen = 0;
-  for (int i = 0; i < Lall.size(); ++i)
+  size_t maxLen = 0;
+  for (size_t i = 0; i < Lall.size(); ++i)
   {
     if (Lall[i].size() > maxLen)
     {
@@ -116,8 +116,10 @@ IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
   }
 
   L.resize(Lall[idxMax].size());
-  for (int i = 0; i < Lall[idxMax].size(); ++i)
+  for (size_t i = 0; i < Lall[idxMax].size(); ++i)
+  {
     L[i] = Lall[idxMax][i];
+  }
 }
 
 template <typename DerivedF, typename DerivedL>
@@ -135,6 +137,11 @@ IGL_INLINE void igl::boundary_loop(
   boundary_loop(F,Lvec);
 
   L.resize(Lvec.size());
-  for (int i = 0; i < Lvec.size(); ++i)
+  for (size_t i = 0; i < Lvec.size(); ++i)
     L(i) = Lvec[i];
 }
+
+#ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
+// Explicit template specialization
+template void igl::boundary_loop<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+#endif

include/igl/frustum.cpp

@@ -19,3 +19,9 @@ IGL_INLINE void igl::frustum(
   P(2,3) = -(2.0 * farVal * nearVal) / (farVal - nearVal);
 }
 
+
+#ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
+// Explicit template specialization
+// generated by autoexplicit.sh
+template void igl::frustum<Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4> >(Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4> >&);
+#endif

include/igl/grad.cpp

@@ -106,4 +106,5 @@ IGL_INLINE void igl::grad(const Eigen::PlainObjectBase<DerivedV>&V,
 // template void igl::grad<double, int>(Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1,-1> const&, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> const&,Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>&);
 template void igl::grad<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::SparseMatrix<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>::Scalar, 0, int>&);
 //template void igl::grad<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::SparseMatrix<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>::Scalar, 0, int>&);
+template void igl::grad<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::SparseMatrix<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, 0, int>&);
 #endif

include/igl/is_border_vertex.cpp

@@ -32,4 +32,5 @@ IGL_INLINE std::vector<bool> igl::is_border_vertex(const Eigen::PlainObjectBase<
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template specialization
 template std::vector<bool, std::allocator<bool> > igl::is_border_vertex<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&);
+template std::vector<bool, std::allocator<bool> > igl::is_border_vertex<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&);
 #endif

include/igl/is_irregular_vertex.cpp

@@ -40,4 +40,5 @@ IGL_INLINE std::vector<bool> igl::is_irregular_vertex(const Eigen::PlainObjectBa
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template specialization
 template std::vector<bool, std::allocator<bool> > igl::is_irregular_vertex<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&);
+template std::vector<bool, std::allocator<bool> > igl::is_irregular_vertex<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&);
 #endif

include/igl/look_at.cpp

@@ -29,3 +29,9 @@ IGL_INLINE void igl::look_at(
   R(1,3) =-u.transpose() * eye;
   R(2,3) = f.transpose() * eye;
 }
+
+#ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
+// Explicit template specialization
+// generated by autoexplicit.sh
+template void igl::look_at<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1>, Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1>, Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1>, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4> >&);
+#endif

include/igl/ortho.cpp

@@ -18,3 +18,9 @@ IGL_INLINE void igl::ortho(
   P(1,3) = - (top + bottom) / (top - bottom);
   P(2,3) = - (farVal + nearVal) / (farVal - nearVal);
 }
+
+#ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
+// Explicit template specialization
+// generated by autoexplicit.sh
+template void igl::ortho<Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4> >(Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4>::Scalar, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4> >&);
+#endif

include/igl/project.cpp

@@ -139,10 +139,9 @@ Eigen::Matrix<Scalar,3,1> igl::project(
 
 
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
-
+// Explicit template instanciations
 #ifndef IGL_NO_OPENGL
 #ifndef IGL_OPENGL_4
-// Explicit template instanciations
 template int igl::project<Eigen::Matrix<double, 3, 1, 0, 3, 1>, Eigen::Matrix<double, 3, 1, 0, 3, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 3, 1, 0, 3, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 3, 1, 0, 3, 1> >&);
 template Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 3, 1, 0, 3, 1> > igl::project<Eigen::Matrix<double, 3, 1, 0, 3, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 3, 1, 0, 3, 1> > const&);
 template int igl::project<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1>, Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> >&);
@@ -155,5 +154,5 @@ template Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 2, 1, 0, 2, 1> > igl::proj
 #endif
 template Eigen::Matrix<double, 3, 1, 0, 3, 1> igl::project<double>(Eigen::Matrix<double, 3, 1, 0, 3, 1> const&, Eigen::Matrix<double, 4, 4, 0, 4, 4> const&, Eigen::Matrix<double, 4, 4, 0, 4, 4> const&, Eigen::Matrix<double, 4, 1, 0, 4, 1> const&);
 #endif
-
+template Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> igl::project<float>(Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> const&, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4> const&, Eigen::Matrix<float, 4, 4, 0, 4, 4> const&, Eigen::Matrix<float, 4, 1, 0, 4, 1> const&);
 #endif

include/igl/slice_tets.cpp

@@ -218,4 +218,5 @@ IGL_INLINE void igl::slice_tets(
 
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template specialization
+template void igl::slice_tets<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, 4, 1, 0, 4, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, double>(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 4, 1, 0, 4, 1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::SparseMatrix<double, 0, int>&);
 #endif

include/igl/sort.cpp

@@ -224,4 +224,5 @@ template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int,
 template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 template void igl::sort_new<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6>, Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6>, Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, 1, 6, 1, 1, 6> >&);
 template void igl::sort<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&);
+template void igl::sort<Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4>, Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4>, Eigen::Matrix<int, -1, 4, 0, -1, 4> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4> > const&, int, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 4, 0, -1, 4> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 4, 0, -1, 4> >&);
 #endif

include/igl/xml/serialize_xml.cpp

@@ -1,3 +1,4 @@
+// This file is part of libigl, a simple c++ geometry processing library.
 //
 // Copyright (C) 2014 Christian Schüller <schuellchr@gmail.com>
 //
@@ -968,3 +969,9 @@ namespace igl
     }
   }
 }
+
+#ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
+// Explicit template specialization
+template void igl::serialize_xml<std::vector<float, std::allocator<float> > >(std::vector<float, std::allocator<float> > const&, std::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> > const&, std::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> > const&, bool, bool);
+template void igl::deserialize_xml<std::vector<float, std::allocator<float> > >(std::vector<float, std::allocator<float> >&, std::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> > const&, std::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> > const&);
+#endif

tutorial/609_Boolean/CMakeLists.txt

@@ -3,6 +3,15 @@ project(609_Boolean)
 
 find_package(CGAL REQUIRED)
 include(${CGAL_USE_FILE})
+# CGAL's monkeying with all of the flags. Rather than change the CGAL_USE_FILE
+# just get ride of this flag.
+# http://stackoverflow.com/a/18234926/148668
+macro(remove_cxx_flag flag)
+  string(REPLACE "${flag}" "" CMAKE_CXX_FLAGS "${CMAKE_CXX_FLAGS}")
+endmacro()
+remove_cxx_flag("-stdlib=libc++")
+
+# This is absolutely necessary for Exact Construction
 
 # for some reason must come after cgal include. I think that it's overwriting
 # come flags like CXX_FLAGS

tutorial/cmake/FindLIBIGL.cmake

@@ -145,6 +145,14 @@ if(LIBIGL_USE_STATIC_LIBRARY)
   else(OPENMP_FOUND)
     set(LIBIGL_FOUND false)
   endif(OPENMP_FOUND)
+
+  FIND_LIBRARY( LIBIGLXML_LIBRARY NAMES iglxml PATHS ${LIBIGL_LIB_DIRS})
+  if(NOT LIBIGLXML_LIBRARY)
+    set(LIBIGL_FOUND FALSE)
+    message(FATAL_ERROR "could NOT find libiglxml")
+  endif(NOT LIBIGLXML_LIBRARY)
+  set(LIBIGL_LIBRARIES ${LIBIGL_LIBRARIES}  ${LIBIGLXML_LIBRARY})
+
 endif(LIBIGL_USE_STATIC_LIBRARY)