Fix template instantiations.

Former-commit-id: 761cb5e91e705be65cbfcace629b7bb334fcf50d

include/igl/AABB.cpp

@@ -1071,4 +1071,5 @@ template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::init<Eigen
 // generated by autoexplicit.sh
 template void igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 2>::init<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&);
 template double igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::squared_distance<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, double, int&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> >&) const;
+template bool igl::AABB<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, 3>::intersect_ray<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, Eigen::Matrix<double, 1, 3, 1, 1, 3> const&, igl::Hit&) const;
 #endif

include/igl/copyleft/tetgen/tetrahedralize.cpp

@@ -1,15 +1,15 @@
 // This file is part of libigl, a simple c++ geometry processing library.
-// 
+//
 // Copyright (C) 2013 Alec Jacobson <alecjacobson@gmail.com>
-// 
-// This Source Code Form is subject to the terms of the Mozilla Public License 
-// v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can 
+//
+// This Source Code Form is subject to the terms of the Mozilla Public License
+// v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can
 // obtain one at http://mozilla.org/MPL/2.0/.
 #include "tetrahedralize.h"
 #include "mesh_to_tetgenio.h"
 #include "tetgenio_to_tetmesh.h"
 
-// IGL includes 
+// IGL includes
 #include "../../matrix_to_list.h"
 #include "../../list_to_matrix.h"
 #include "../../boundary_facets.h"
@@ -19,11 +19,11 @@
 #include <iostream>
 
 IGL_INLINE int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize(
-  const std::vector<std::vector<REAL > > & V, 
-  const std::vector<std::vector<int> > & F, 
+  const std::vector<std::vector<REAL > > & V,
+  const std::vector<std::vector<int> > & F,
   const std::string switches,
-  std::vector<std::vector<REAL > > & TV, 
-  std::vector<std::vector<int > > & TT, 
+  std::vector<std::vector<REAL > > & TV,
+  std::vector<std::vector<int > > & TT,
   std::vector<std::vector<int> > & TF)
 {
   using namespace std;
@@ -60,10 +60,10 @@ IGL_INLINE int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize(
 }
 
 template <
-  typename DerivedV, 
-  typename DerivedF, 
-  typename DerivedTV, 
-  typename DerivedTT, 
+  typename DerivedV,
+  typename DerivedF,
+  typename DerivedTV,
+  typename DerivedTT,
   typename DerivedTF>
 IGL_INLINE int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize(
   const Eigen::PlainObjectBase<DerivedV>& V,
@@ -101,12 +101,12 @@ IGL_INLINE int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize(
 }
 
 template <
-  typename DerivedV, 
-  typename DerivedF, 
-  typename DerivedVM, 
-  typename DerivedFM, 
-  typename DerivedTV, 
-  typename DerivedTT, 
+  typename DerivedV,
+  typename DerivedF,
+  typename DerivedVM,
+  typename DerivedFM,
+  typename DerivedTV,
+  typename DerivedTT,
   typename DerivedTF,
   typename DerivedTM>
 IGL_INLINE int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize(
@@ -124,7 +124,7 @@ IGL_INLINE int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize(
   vector<vector<REAL> > vV,vTV;
   vector<vector<int> > vF,vTT,vTF;
   vector<int> vTM;
-	
+
   matrix_to_list(V,vV);
   matrix_to_list(F,vF);
 	vector<int> vVM = matrix_to_list(VM);
@@ -156,13 +156,13 @@ IGL_INLINE int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize(
   return e;
 }
 IGL_INLINE int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize(
-  const std::vector<std::vector<REAL > > & V, 
-  const std::vector<std::vector<int> > & F, 
-  const std::vector<int> & VM, 
+  const std::vector<std::vector<REAL > > & V,
+  const std::vector<std::vector<int> > & F,
+  const std::vector<int> & VM,
 	const std::vector<int> & FM,
   const std::string switches,
-  std::vector<std::vector<REAL > > & TV, 
-  std::vector<std::vector<int > > & TT, 
+  std::vector<std::vector<REAL > > & TV,
+  std::vector<std::vector<int > > & TT,
   std::vector<std::vector<int> > & TF,
   std::vector<int> & TM)
 {
@@ -216,4 +216,5 @@ IGL_INLINE int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize(
 // Explicit template instantiation
 template int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 template int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>,Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>,Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>,Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>,Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>,Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>,Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>,Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(const Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > &,const Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > &,const Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > &,const Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > &,const std::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >,Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > &,Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > &,Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > &, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > &);
+template int igl::copyleft::tetgen::tetrahedralize<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::__cxx11::basic_string<char, std::char_traits<char>, std::allocator<char> >, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 #endif

include/igl/exact_geodesic.cpp.REMOVED.git-id

@@ -1 +1 @@
-0ffa8b0392da9471a2fd26ec71effd909d4a75f3
+a0c5a93d2bc144890fbfa8d5e413d4dddc4a2827

include/igl/matrix_to_list.cpp

@@ -75,4 +75,5 @@ template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::D
 template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, std::vector<std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> >, std::allocator<std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>::Scalar> > > >&);
 template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> >&);
 template void igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1> > const&, std::vector<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, 1, -1, 1, 1, -1>::Scalar> >&);
+template std::vector<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar, std::allocator<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>::Scalar> > igl::matrix_to_list<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&);
 #endif

include/igl/ray_mesh_intersect.cpp

@@ -1,9 +1,9 @@
 // This file is part of libigl, a simple c++ geometry processing library.
-// 
+//
 // Copyright (C) 2016 Alec Jacobson <alecjacobson@gmail.com>
-// 
-// This Source Code Form is subject to the terms of the Mozilla Public License 
-// v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can 
+//
+// This Source Code Form is subject to the terms of the Mozilla Public License
+// v. 2.0. If a copy of the MPL was not distributed with this file, You can
 // obtain one at http://mozilla.org/MPL/2.0/.
 #include "ray_mesh_intersect.h"
 
@@ -15,8 +15,8 @@ extern "C"
 template <
   typename Derivedsource,
   typename Deriveddir,
-  typename DerivedV, 
-  typename DerivedF> 
+  typename DerivedV,
+  typename DerivedF>
 IGL_INLINE bool igl::ray_mesh_intersect(
   const Eigen::MatrixBase<Derivedsource> & s,
   const Eigen::MatrixBase<Deriveddir> & dir,
@@ -26,14 +26,14 @@ IGL_INLINE bool igl::ray_mesh_intersect(
 {
   using namespace Eigen;
   using namespace std;
-  // Should be but can't be const 
+  // Should be but can't be const
   Vector3d s_d = s.template cast<double>();
   Vector3d dir_d = dir.template cast<double>();
   hits.clear();
   // loop over all triangles
   for(int f = 0;f<F.rows();f++)
   {
-    // Should be but can't be const 
+    // Should be but can't be const
     RowVector3d v0 = V.row(F(f,0)).template cast<double>();
     RowVector3d v1 = V.row(F(f,1)).template cast<double>();
     RowVector3d v2 = V.row(F(f,2)).template cast<double>();
@@ -57,8 +57,8 @@ IGL_INLINE bool igl::ray_mesh_intersect(
 template <
   typename Derivedsource,
   typename Deriveddir,
-  typename DerivedV, 
-  typename DerivedF> 
+  typename DerivedV,
+  typename DerivedF>
 IGL_INLINE bool igl::ray_mesh_intersect(
   const Eigen::MatrixBase<Derivedsource> & source,
   const Eigen::MatrixBase<Deriveddir> & dir,
@@ -81,4 +81,5 @@ IGL_INLINE bool igl::ray_mesh_intersect(
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 template bool igl::ray_mesh_intersect<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1>, Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, std::vector<igl::Hit, std::allocator<igl::Hit> >&);
+template bool igl::ray_mesh_intersect<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1>, Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<float, 3, 1, 0, 3, 1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, igl::Hit&);
 #endif

python/CMakeLists.txt

@@ -144,7 +144,7 @@ elseif(UNIX)
   # .SO file extension on Linux/Mac OS
   set_target_properties(pyigl PROPERTIES SUFFIX ".so")
 
-  #Enable flag if undefined symbols appear on pyigl module import to get notified about the missing symbols at link time
+  # Enable flag if undefined symbols appear on pyigl module import to get notified about the missing symbols at link time
   option(CHECK_UNDEFINED        "Check for undefined symbols"    OFF)
 
   # Strip unnecessary sections of the binary on Linux/Mac OS