templates and prototypes

Former-commit-id: 5c920aeb24df49fe267a36b7e1f14e80bee22534

include/igl/avg_edge_length.cpp

@@ -11,12 +11,13 @@
 
 template <typename DerivedV, typename DerivedF>
 IGL_INLINE double igl::avg_edge_length(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedV>& V,
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedF>& F)
+  const Eigen::MatrixBase<DerivedV>& V,
+  const Eigen::MatrixBase<DerivedF>& F)
 {
   double avg = 0;
   long int count = 0;
 
+  // Augh. Technically this is double counting interior edges...
   for (unsigned i=0;i<F.rows();++i)
   {
     for (unsigned j=0;j<F.cols();++j)
@@ -32,7 +33,7 @@ IGL_INLINE double igl::avg_edge_length(
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 // generated by autoexplicit.sh
-template double igl::avg_edge_length<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&);
-template double igl::avg_edge_length<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&);
+template double igl::avg_edge_length<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&);
+template double igl::avg_edge_length<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 3, 0, -1, 3> > const&);
 // generated by autoexplicit.sh
 #endif

include/igl/avg_edge_length.h

@@ -29,8 +29,8 @@ namespace igl
   // See also: adjacency_matrix
   template <typename DerivedV, typename DerivedF>
   IGL_INLINE double avg_edge_length(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedV>& V,
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedF>& F);
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedV>& V,
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedF>& F);
 
 }
 

include/igl/edges.cpp

@@ -42,4 +42,5 @@ IGL_INLINE void igl::edges(
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 template void igl::edges<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&);
+template void igl::edges<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
 #endif

include/igl/ismember.cpp

@@ -18,8 +18,8 @@ template <
   typename DerivedIA,
   typename DerivedLOCB>
 IGL_INLINE void igl::ismember(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA> & A,
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedB> & B,
+  const Eigen::MatrixBase<DerivedA> & A,
+  const Eigen::MatrixBase<DerivedB> & B,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA> & IA,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedLOCB> & LOCB)
 {
@@ -42,8 +42,8 @@ IGL_INLINE void igl::ismember(
   // Get rid of any duplicates
   typedef Matrix<typename DerivedA::Scalar,Dynamic,1> VectorA;
   typedef Matrix<typename DerivedB::Scalar,Dynamic,1> VectorB;
-  const VectorA vA(Eigen::Map<const VectorA>(A.data(), A.cols()*A.rows(),1));
-  const VectorB vB(Eigen::Map<const VectorB>(B.data(), B.cols()*B.rows(),1));
+  const VectorA vA(Eigen::Map<const VectorA>(DerivedA(A).data(), A.cols()*A.rows(),1));
+  const VectorB vB(Eigen::Map<const VectorB>(DerivedB(B).data(), B.cols()*B.rows(),1));
   VectorA uA;
   VectorB uB;
   Eigen::Matrix<typename DerivedA::Index,Dynamic,1> uIA,uIuA,uIB,uIuB;
@@ -97,8 +97,8 @@ template <
   typename DerivedIA,
   typename DerivedLOCB>
 IGL_INLINE void igl::ismember_rows(
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA> & A,
-  const Eigen::PlainObjectBase<DerivedB> & B,
+  const Eigen::MatrixBase<DerivedA> & A,
+  const Eigen::MatrixBase<DerivedB> & B,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA> & IA,
   Eigen::PlainObjectBase<DerivedLOCB> & LOCB)
 {
@@ -174,6 +174,8 @@ IGL_INLINE void igl::ismember_rows(
 
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
-template void igl::ismember<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<bool, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<bool, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
-template void igl::ismember_rows<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::ismember<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<bool, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<bool, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::ismember_rows<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Array<bool, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::ismember_rows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<bool, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<bool, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::ismember_rows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<bool, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<bool, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 #endif

include/igl/ismember.h

@@ -28,8 +28,8 @@ namespace igl
     typename DerivedIA,
     typename DerivedLOCB>
   IGL_INLINE void ismember(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA> & A,
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedB> & B,
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedA> & A,
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedB> & B,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA> & IA,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedLOCB> & LOCB);
   template <
@@ -38,8 +38,8 @@ namespace igl
     typename DerivedIA,
     typename DerivedLOCB>
   IGL_INLINE void ismember_rows(
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedA> & A,
-    const Eigen::PlainObjectBase<DerivedB> & B,
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedA> & A,
+    const Eigen::MatrixBase<DerivedB> & B,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedIA> & IA,
     Eigen::PlainObjectBase<DerivedLOCB> & LOCB);
 

include/igl/list_to_matrix.cpp

@@ -119,6 +119,8 @@ IGL_INLINE bool igl::list_to_matrix(const std::vector<T > & V,Eigen::PlainObject
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 // generated by autoexplicit.sh
+template bool igl::list_to_matrix<long, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(std::vector<std::vector<long, std::allocator<long> >, std::allocator<std::vector<long, std::allocator<long> > > > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+// generated by autoexplicit.sh
 template bool igl::list_to_matrix<bool, Eigen::Array<bool, -1, 3, 0, -1, 3> >(std::vector<std::vector<bool, std::allocator<bool> >, std::allocator<std::vector<bool, std::allocator<bool> > > > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Array<bool, -1, 3, 0, -1, 3> >&);
 // generated by autoexplicit.sh
 template bool igl::list_to_matrix<double, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1> >(std::vector<std::vector<double, std::allocator<double> >, std::allocator<std::vector<double, std::allocator<double> > > > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1> >&);

include/igl/max_size.cpp

@@ -27,6 +27,8 @@ IGL_INLINE int igl::max_size(const std::vector<T> & V)
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 // generated by autoexplicit.sh
+template int igl::max_size<std::vector<long, std::allocator<long> > >(std::vector<std::vector<long, std::allocator<long> >, std::allocator<std::vector<long, std::allocator<long> > > > const&);
+// generated by autoexplicit.sh
 template int igl::max_size<std::vector<unsigned int, std::allocator<unsigned int> > >(std::vector<std::vector<unsigned int, std::allocator<unsigned int> >, std::allocator<std::vector<unsigned int, std::allocator<unsigned int> > > > const&);
 // generated by autoexplicit.sh
 template int igl::max_size<std::vector<int, std::allocator<int> > >(std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > > const&);

include/igl/min_size.cpp

@@ -33,6 +33,8 @@ IGL_INLINE int igl::min_size(const std::vector<T> & V)
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 // generated by autoexplicit.sh
+template int igl::min_size<std::vector<long, std::allocator<long> > >(std::vector<std::vector<long, std::allocator<long> >, std::allocator<std::vector<long, std::allocator<long> > > > const&);
+// generated by autoexplicit.sh
 template int igl::min_size<std::vector<unsigned int, std::allocator<unsigned int> > >(std::vector<std::vector<unsigned int, std::allocator<unsigned int> >, std::allocator<std::vector<unsigned int, std::allocator<unsigned int> > > > const&);
 // generated by autoexplicit.sh
 template int igl::min_size<std::vector<int, std::allocator<int> > >(std::vector<std::vector<int, std::allocator<int> >, std::allocator<std::vector<int, std::allocator<int> > > > const&);

include/igl/slice.cpp

@@ -248,6 +248,10 @@ IGL_INLINE DerivedX igl::slice(
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 // generated by autoexplicit.sh
+template void igl::slice<Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>&);
+// generated by autoexplicit.sh
+template void igl::slice<Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>&);
+// generated by autoexplicit.sh
 template void igl::slice<Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>&);
 // generated by autoexplicit.sh
 template void igl::slice<Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> >, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::MatrixBase<Eigen::Matrix<double, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> > const&, int, Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>&);

include/igl/sortrows.cpp

@@ -108,6 +108,8 @@ IGL_INLINE void igl::sortrows(
 #ifdef IGL_STATIC_LIBRARY
 // Explicit template instantiation
 // generated by autoexplicit.sh
+template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+// generated by autoexplicit.sh
 template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 // generated by autoexplicit.sh
 template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
@@ -118,4 +120,5 @@ template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matri
 template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -1> >&);
+template void igl::sortrows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, bool, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 #endif

include/igl/unique.cpp

@@ -293,4 +293,6 @@ template void __cdecl igl::unique_rows<class Eigen::Matrix<int, -1, -1, 0, -1, -
 
 template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 2, 0, -1, 2> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 1, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<int, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, -1, 0, -1, -1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
+template void igl::unique_rows<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1>, Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >(Eigen::DenseBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> > const&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<double, -1, 3, 0, -1, 3> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&, Eigen::PlainObjectBase<Eigen::Matrix<long, -1, 1, 0, -1, 1> >&);
 #endif